El Doctorado en Ciencias en Química dispone de suficiente infraestructura para desarrollar investigación de alto nivel en sus Líneas de Generación y Aplicación del Conocimiento. Es posible desarrollar proyectos de investigación experimentales, teóricos o teórico-experimentales, ya que, los profesores y estudiantes de este posgrado realizan sus actividades de investigación en los siguientes laboratorios:
a) Laboratorio de Electroquímica y Corrosión.
b) Laboratorio de Fisicoquímica.
d) Laboratorio de Química Orgánica y Organometálica.
e) Laboratorio de Química del Estado Sólido.
f) Laboratorio de Síntesis y Caracterización de Polímeros.
g) Laboratorio de Química Teórica.
h) Laboratorio de Espectroscopia.
i) Laboratorio de Análisis Externos.
j) Laboratorio de Análisis Químico Cuantitativo.
k) Laboratorio de Productos Naturales.
l) Laboratorio de Fermentaciones y Biocatálisis.
m) Laboratorio de Bioquímica Estructural.
n) Laboratorio de Inmunofarmacología.